FKpt Markus Mirsberger trat als Offizieranwärter 1998 in die Deutsche Marine ein und hat im Rahmen seiner Ausbildung ein Maschinenbaustudium (FH) an der UniBw München mit der Fachrichtung Energie- und Marinetechnik abgeschlossen.
In der Marine fuhr er u.a. auf den Fregatten BAYERN und SACHSEN im Bereich der Führungsmittel- und Waffentechnik zur See.
In weiteren Verwendungen hat er sich mit der Vernetzung von Waffensystemen mittels Taktischer Datenlinks und im Rahmen der integrierten Luftverteidigung beschäftigt. Zusätzlich war er im Bereich Operations-Research eingesetzt. 2023 hat er den Lehrgang Generalstabs-/Admiralstabsdienst international in Hamburg absolviert.
Seit April 2024 leitet er das Kompetenzzentrum Infrastructure and Cloud Base, User Equipment (ICU) im Zentrum für Digitalisierung der Bw in Bonn.